Jules, page pro - page perso

Nouveau site internet pour la French Connexion Uppsala !

2010-11-22T21:08:54Z

New website for the French Connexion Uppsala!

2010-11-22T21:06:49Z

303 Soil Science laboratories listed and mapped!

2009-06-29T13:45:12Z

The list and maps of Soil Science laboratories and research team I made has now reached 303 laboratories, from 51 countries.

In addition to the directory available in various formats (text, HTML, KML), the code of the R functions that I created to "produce" these documents is now available too.

303 laboratoires de Science du Sol recensés et cartographiés !

2009-06-29T13:42:50Z

Ce sont désormais 303 laboratoires et équipes de chercheurs en Science du Sol, dans 51 pays qui sont recensés (et cartographiés) dans le répertoire que j'ai créé.

En plus du répertoire disponible en plusieurs formats (texte, HTML, KML), le code des fonctions R que j'ai crées pour "produire" ces documents est désormais disponible aussi.

Picture :: Lille, winter 2006

2007-02-03T18:02:13Z

I posted some pictures of Lille. I took these pictures during a two day trip in the 'city of the North', at the end 2006.

Photos :: Lille, hivers 2006

2007-02-03T17:55:23Z

J'ai ajouté des photos de Lille à la galerie photo. Elles ont été prises lors d'une escapade de deux jours dans la 'ville du Nord', fin 2006.

Changes in site URLs

2007-01-28T16:04:06Z

This site is written with the CMS spip By default, the urls looks like http://julienmoeys.free.fr/?article4 That's not very readable for internet users as well as for search engines! So i decided to use spip 'customised urls' (fr: url propres or url personnalisées) proposed by spip, with their option 'propres-qs' (the only one that works with free.fr) and slightly modified configuration file propres.php that is in spip \ecrire\url\ folder. By this way i get a little bit more 'sexy' and not truncated urls (articles urls are based on their sup-title (fr: sur-titre) and not on their title; see here for the modified file) I hope these changes wont cause you any unattended disagreement!

Modification des urls du site

2007-01-28T15:48:39Z

Ce site écrit à l'aide du CMS spip Par défaut les urls son du type http://julienmoeys.free.fr/?article4 Ce qui n'est pas très lisible pour les internautes, ni pour les moteurs de recherche ! J'ai donc adopté les 'url propres' proposés par spip, dans leur variante 'propres-qs' (seule qui fonctionne avec free.fr) en modifiant légèrement le fichier de configuration propres.php qui se trouve dans le dossier \ecrire\url\ de spip afin d'obtenir des url un peu plus 'sexy' et pas tronquées (l'url des articles est basée sur leur sur-titre et non sur leur titre ; voir ici pour le fichier modifié) J'espère que ces modifications ne causeront pas de désagréments inattendus.

Pictures :: Scotland + Corrèze (France)

2006-12-27T11:12:42Z

I have added some pictures taken during hollidays/walks in Scotland (summer 2004) and in Corrèze (France) (summer 2006).

Photos :: Ecosse + Corrèze

2006-12-27T11:09:04Z

J'ai ajouté quelques photos de randonnée en Ecosse (été 2004) et en Corrèze (été 2006).

The Soil Texture Wizard: graphs, classifications, transformations and exploration of soil texture data with R

Julien Moeys — 2009-08-29T20:23:45Z

Summary

Warning
Soil texture triangle gallery (images)
Features list
Functions source code (.R; last version);
Complete tutorial (pdf; last version);
Other works and softwares on soil textures (triangles)
(No?) future developments
Contact, license, credit and (absence of) guaranty

Warning

The R functions, the tutorial and the texture triangles images presented here are provided without any guaranty of conformity with the original classifications (a "certification" work of these triangles is unfortunately totally out of my prerogatives).

As the functions behind "The Soil Texture Wizard" have not been tested by 'independent' users, they may be modified in order to correct eventual bugs. I will try as much as possible to avoid any change that could hamper the compatibility between different versions of these functions, but I can not guarantee that compatibility will always be maintained.

Soil texture triangles gallery

If you are a R user (an interpreted programming language dedicated to statistics; See the R page on Wikipedia, I have created a gallery of soil texture triangles (images) that presents the 7 triangles implemented in the set of functions.

Features list

"The Soil Texture Wizard" is an integrated set of functions for the R software for statistical computing, that allows to:

Create clear, readable soil texture triangles graphics (also called ternary plots or soil texture diagrams), with proper axis labels, either "neutral", or with one of the 8 soil texture classification systems actually pre-defined:
— USDA;
— FAO (which is also the triangle for the soil map of Europe);
— Aisne (France);
— GEPPA (France);
— German triangle (Bodenkundliche Kartieranleitung 1994);
— Soil Survey of England and Wales (UK);
— Australian triangle;
— Belgian triangle (new 2009/10/15).
— Canadian triangle (new 2010/04/16).
— ISSS triangle (new 2010/05/13).

Many thanks to Wei Shangguan, PhD student at the School of geography of Beijing normal university for providing the code of ISSS the triangle.

Implement new texture triangles or create personalized texture triangles, that will be usable as any of the above mentioned soil textures triangle (graphs, classification, etc.);

Numerous graphical possibilities to display soil texture data in a texture triangle, following an option system similar to R plot(), points() and text() functions:
— Simple graphics (points);
— Bubble charts (points sizes and colors are proportional to a 4th variable);
— Graph with text instead of points.

Calculate the texture class(es) (= classification) to which belong soil texture data, in 1 of the 7 predefined system / classification / triangle (or your own custom triangle);

Transform soil textures data from 1 particle sizes system (limits between the clay, silt and sand particles) to another particle size system, with a log-linear transformation (estimation). For instance, it is possible to convert a textures data table measured in a system that have a silt / sand limit is 60 micrometers into a system that has a silt / sand limit is 50 micrometers. It is also possible to define your own texture transformation function, and use it for 'on-the-fly' transformation of data in texture plots or for texture classification [1].;

Display a texture triangle / classification in a (triangle) geometry different from its default (triangle) geometry. For instance, a texture triangle / classification usually displayed in an isosceles triangle can be displayed in a right-angled triangle. The geometrical parameters that can be changed are:
— The 3 angles of the triangle (free);
— The "direction" of increasing textures for each axes (clockwise, anti-clockwise or "centripetal");
— The location of the 3 texture classes (clay, silt and sand) on the 3 axes (abscissae, left or right axis).

Over-plot / superimpose 2 different texture triangles / classifications into one single plot, whatever their initial "geometry" (for instance the German right-angled soil texture triangle and the USDA isosceles texture triangle can be over-plotted (into a given geometry));

'On the fly' transformation of textures data particle size when plotting a soil texture triangle;

'On the fly' transformation of a triangle particle size when over-plotting 2 (different) texture triangles;

Contour plot or image plot of:
— 2D kernel density estimation (based on R-MASS kde2d function) (new 2009/10/13)
— Mahalanobis distance (based on R mahalanobis function), with or without additive log-ratio transformation (new 2009/10/13)
— Inverse weighted distance estimate / smoothing of a 4th variable;

'Normalisation' of texture data's 'sum of the 3 texture classes' to 100% (new 2009/10/13).

Chose between 7 languages for the plot title and the 3 axes legends (English, French, Swedish, German, Spanish, Italian and Dutch), with a simple option;

Most of the functions are optimised for speed, and are thus suitable for mass / batch treatment of soil textures data:
— 3400 soil textures data 'transformed' per second;
— 14000 soil textures data "classified" per second;

(Under Windows XP, Intel Core 2 Duo, 2,66 Ghz, 3,23 Gb of RAM)

Want to know more?

You can have a look at the last version of the tutorial and his numerous figures and examples, to visualise the features offered by "The Soil Texture Wizard", and download the functions source code (.R) to try them.

These functions are still under development, check the changelog file.

Other works and softwares dealing with soil textures

Numerous other works and softwares exist that deal with soil textures and soil textures triangles. Nevertheless, to my knowledge, The Soil Texture Wizard is the only tool that offers an integrated set of functionalities for soil textures (smart graphs + classification + multi-triangle + multi-geometry).

Ternary graphs (without soil textures classes):

— triangle.plot() and triangle.biplot() functions, from the R package ADE4, by Daniel Chessel, Anne-Beatrice Dufour and Stephane Dray. These functions are not specialised in soil textures plots (and can not plot soil texture classes), but offer of nice "zoom" feature that don't exist in The Soil Texture Wizard, nor in the PLOTRIX package (see below) [2]. For illustrations, see the web-page on triangle.plot() on the R Graph Gallery, by Romain Francois.

— ternaryplot() function in the R package VCD by David Meyer, Achim Zeileis and Kurt Hornik. For illustrations, see the web-page on ternaryplot() on the R Graph Gallery, by Romain Francois.

Ternary graphs (with soil textures classes):

— The functions soil.texture() and soil.texture.uk() from the R package PLOTRIX, by Jim Lemon et al. It allows to create graphs, with or without soil textures data, following the USDA or the UK soil texture triangles. There is also an underlying ternary plot function that can be used without soil texture classes. It is nevertheless not possible to project the triangles into another geometry, nor to transform or classify soil textures data. The R functions presented here ("The Soil Texture Wizard") are originally (i.e. 3 years ago) derived from some functions of the PLOTRIX package. Now, there probably not a single common line of code, and the 2 set of functions are unfortunately not compatible. But The Soil Texture Wizard obviously wouldn't exist if I haven't been able to freely adapt the code from PLOTRIX (reason why free and open-source licences are so great). For illustrations of PLOTRIX, see the web-page on soil.texture() on the R Graph Gallery, by Romain Francois.

Automatic classification:

— Texture Autolookup, by Christopher Teh Boon Sung is a standalone program, with a graphical user interface, that can classify soil textures following the USDA, UK, Canadian, FAO texture triangles, or 7 other systems. The work has been published in two articles of "Communications in Soil and Plant Analysis", in 1996 and 2003->http://www.christopherteh.com/tal/index.html]). The software also allows to plot / visualise soil texture data (but the plot function is not very advanced), in 2 different triangle geometries.

— TRIANGLE, "A Program For Soil Textural Classification", by Aris Gerakis and Brian Baer allows to classify soil textures data after the USDA soil texture triangle (published in the Soil Science Society of America Journal in 1999).

— r.soils.texture is a [Grass-GIS http://grass.osgeo.org/] add-on for classifying raster files of soil textures with 3 classification systems (USDA, FAO, ISSS). Note that this is not R code.

Articles related to soil texture triangles or systems

— Richer de Forges A., Feller C., Jamagne M. & Arrouays D., 2008. "Perdus dans le triangle des textures" (Études et Gestion des Sols, 15:2, pp. 97-111) (en: "Lost in the textures triangle") are presenting a gallery of 29 soil textures triangles, either still in use nowadays or that were used in the past, from France and other countries, and comparing the location of soil texture triangles limits between several triangles. The article also presents a table comparing the particle size limits (for clay, silt and sand fractions) between numerous countries. See also their poster in English. The "comparison" work has been done with a geographic information system (ArcGIS?).

— B. Minasny and A.B. McBratney. The australian soil texture boomerang: a comparison of the australian and usda/fao soil particle-size classication systems. Australian Journal of Soil Research, 39:1443—1451, 2001. LINK.

— A. Nemes, J.H.M. Wösten, A. Lilly, and J.H. Oude Voshaar. Evaluation of different procedures to interpolate particle-size distributions to achieve compatibility within soil databases. Geoderma, 90:187—202, 1999. LINK.

(No?) Future developments

The development of The Soil Texture Wizard set of functions has started due to my need for "manipulating" more easily soil texture data (and graphs) during my work (PhD and PostDoc). There is also a very significant 'personal' investment to make these functions usable by other users.

My present work is less (or not at all) related to international soil textures data collection, and my personal investment to develop these functions will also decrease drastically...

So, apart from a debugging work, future possible developments are:
Register The Soil Texture Wizard as an R contributed package on R forge;
Write an "integrated help", as for most of the R functions;
Complete and improve the existing tutorial / vignette.

For further developments, you will have to consider doing them yourself!

Contact, licence, credits and (absence of) guaranties

Contact:

You can contact me, flag eventual errors or inaccuracies by writing at the following address:

jules

-website

oo.fr

[The "image" parts of the address must be copied "manually"! (anti spam tip...)]

Copyleft: Julien MOEYS

Licence of this article and of the tutorial:

This work by Julien MOEYS is licenced under a Creative Commons Licence (Attribution-Share Alike 3.0 Unported).

In other words, you are allowed to copy and distribute this article and the tutorial presented here, to modify them, and even to include them in a commercial activity, if three conditions are met: (1) cite in a way or another the author, (2) maintain the documents and their modified versions under their original license and (3), in case of modifications of the original document, state in a non-ambiguous way that changes were done to the original document. Rename this document, so it is clear that the modifications are not endorsed by the original author.

Licence of the R functions:

The set of R functions presented here, under the name "The Soil Texture Wizard", are licensed under a GNU General Public License version 3.

Guaranties:

The R functions and the documents presented here have been created and tested carefully but, given the free distribution of this work and the highly permissive license, the author is not providing any guarantee of exactitude of the data and functions, and decline any responsibility regarding the use that could be done with that work.

Disclaimer:

The author is actually working for the Swedish University of Agricultural Sciences, SLU and has been employed by the "Environment and Arable Crops" (EGC) research unit (Grignon, France).

This work doesn't engage the responsibility of the Swedish University of Agricultural Sciences, SLU.

The Soil Texture Wizard : graphiques, classifications, transformations et exploration de textures de sols avec R

Julien Moeys — 2009-08-29T20:23:22Z

Sommaire

Avertissement ;
Galerie de triangles des textures (images) ;
Liste des fonctionnalités ;
Code source des fonctions (.R ; dernière version)
Tutoriel complet (pdf, en anglais ; dernière version) ;
Autres travaux et logiciels sur les (triangles des) textures de sols
Développements futurs (ou non)
Contact, licence, crédits et (absence de) garanties

Avertissement

Les fonctions R, le tutoriel et les images de triangles de textures présentées ici sont fournies sans aucune garantie de conformité avec les "références" originales des différentes classification (un travail de "certification" de ces dernier sort totalement de mes prérogatives, malheureusement).

Galerie de triangles des textures

Si vous n'êtes pas un utilisateur de R (un langage de programmation interprété dédié aux statistiques, voir la page Wikipedia en français), j'ai crée une galerie de triangles des textures (images) qui présente ces derniers.

Liste des fonctionnalités

"The Soil Texture Wizard" est un ensemble "intégré" de fonctions pour le logiciel statistique R, permettant de :

Créer des graphiques de "triangles des textures de sols" (aussi appelés graphiques ternaires) clairs, lisibles et proprement légendés, soit "neutres", soit suivant un des 7 systèmes de classification des textures (ou "triangles") actuellement prédéfinis :
— USDA ;
— FAO (qui est aussi celui de la carte des sols d'Europe) ;
— Aisne (France) ;
— GEPPA (France) ;
— Triangle Allemand (Bodenkundliche Kartieranleitung 1994) ;
— Soil Survey of England and Wales (UK) ;
— Triangle Australien.
— Triangle Belge (nouveau 2009/10/15) ;
— Triangle Canadien (nouveau 2010/04/16) ;
— Triangle ISSS (nouveau 2010/05/13).

Un grand merci à Wei Shangguan, doctorant à l'Ecole de Géographie de l'École Normale de Beijing pour avoir préparé le code du triangle ISSS.

Implémenter de nouveaux triangles de texture ou créer des triangles de texture personnalisés, qui sont alors utilisables comme n'importe quel triangle de textures prédéfini (graphiques, classification, etc.) ;

Nombreuses possibilité graphiques pour afficher des données de texture dans un triangle des textures, suivant un système d'options similaires aux fonctions plot(), points() et text() de R :
— Graphique simple (points)
— Graphiques à bulles (taille et couleur proportionnelle à une 4e variable)
— Affichage de texte au lieu de points ;

Calculer la (ou les) classes de textures (= classification) à laquelle/auxquelles appartiennent des données de textures de sols, dans chacun des 7 systèmes prédéfinis ;

Transformer un tableau de textures de sols d'un système de tailles de particules (limites entre les fractions argile, limon et sable) à un autre, par une transformation loglinéaire (estimation). Par exemple, il est possible d'estimer/de convertir d'un tableau de textures mesuré dans un système avec une limite limon/sable à 60 micromètres à un système avec une limite limon/sable à 50 micromètres. Possibilité de définir sois même la fonction de transformation des textures, qui pourra ensuite être utilisée de pour les transformations 'à la volée' lors de la création graphiques ou lors de la classification de données de textures de sol ;

Afficher un triangle des textures/classification dans avec une "géométrie" différente de la géométrie par défaut. Par exemple un triangle isocèle peut être affiché en triangle rectangle. Les paramétres qui peuvent être modifiés sont :
— Les 3 angles du triangle (libres) ;
— La "direction" des textures croissantes de chacun des axes (horaires, anti-horaire ou "centripète") ;
— La localisation des 3 classes de taille de particules (argile, limon, sable) sur les 3 axes (axe des abscisses, axe de gauche et axe de droite) ;

Superposer deux "triangles des textures/classifications" différentes sur un seul et même graphique, et ce quelles que soient les différences "géométriques" des triangles originaux ;

Transformer "à la volée" la taille de particules d'un tableau de textures de sols lors de la production d'un triangle des textures ;

Transformer "à la volée" la taille de particule d'un triangle de textures de sols lors de sa superposition avec un autre triangle des textures ;

Graphiques contour ou raster de :
— Estimation de la "2D kernel density" (basé sur la fonction kde2d de R-MASS) (nouveau 2009/10/13)
— Distance de Mahalanobis (basé sur la fonction R mahalanobis), avec ou sans transformation par log-ratio additif (nouveau 2009/10/13)
— Inverse weighted distance estimate / smoothing of a 4th variable ;

'Normalisation' de la somme des classes de texture à 100% (nouveau 2009/10/13).

Possibilité d'afficher le titre, et les légendes des 3 axes dans 7 langues (Anglais, Français, Suédois, Allemand, Espagnol, Italien et Hollandais), par une simple option ;

La plupart des fonctions sont "optimisées" pour une exécution rapide, et donc sont utilisables pour le "traitement de masse" (batch) de donnés :
— 3400 données de textures "transformées" par secondes ;
— 14000 données de textures "classées" par secondes ;

(sur Windows XP, Intel Core 2 Duo 2,66 Ghz, 3,23 Gb de RAM)

En savoir plus :

Vous pouvez parcourir le tutoriel (en anglais) et ses nombreuses figures et exemples, pour visualiser les possibilités offertes par "The Soil Texture Wizard", et les essayer en téléchargeant le code source des fonctions (.R)

Autres travaux et logiciels sur les triangles des textures de sols

De nombreux autres travaux et logiciels existent pour travailler sur les triangles des textures de sols. Néanmoins, à ma connaissance, "The Soil Texture Wizard" est le seul qui offre un ensemble intégré de fonctionnalités pour les triangles des textures de sols (graphiques + classifications + transformations multi-triangles, multi-géométrie et multi-système de taille de particules).

Graphiques ternaires (sans classes de texture) :

— Fonctions triangle.plot() et triangle.biplot() du paquet/package R ADE4 de Daniel Chessel, Anne-Beatrice Dufour et Stephane Dray. Ces fonctions ne sont pas spécialisées dans les triangles des textures, mais elles offrent une possibilité de "zoom" intégrée qui n'existe ni dans "The Soil Texture Wizard", ni dans PLOTRIX (voir ci-dessous) [3]. Voir pour illustration la page de triangle.plot() sur la galerie de graphiques R de Romain François (R graph Gallery).

— Fonction ternaryplot() du paquet/package R VCD de David Meyer, Achim Zeileis et Kurt Hornik. Voir pour illustration la page de ternaryplot() sur la galerie de graphiques R de Romain François (R graph Gallery).

Graphiques (avec classes de texture) :

— Fonction soil.texture() et soil.texture.uk() du paquet/package R PLOTRIX, de Jim Lemon et al. Il permet de créer des graphiques, avec ou sans données de textures de sols, suivant le triangles des textures USDA ou UK. Il n'est pas possibles de projeter les triangles dans une autre "géométrie", ni de transformer, ni de classer les données de textures. Voir pour illustration la page de soil.texture() sur la galerie de graphiques R de Romain François (R graph Gallery). Les fonctions présentées ici ("The Soil Texture Wizard"), sont initialement (i.e. il y a plus de 3 ans) dérivées des fonctions du package PLOTRIX. Elles n'ont probablement plus une seule ligne de code en commun aujourd'hui, et ne sont malheureusement pas compatibles. "The Soil Texture Wizard" n'existerai pas si je n'avais pas pu m'inspirer librement de leur code (vive les licences libres & open-sources).

Classification automatique :

— Texture Autolookup, de Christopher Teh Boon Sung est un programme, avec interface graphique, qui peut classifier des textures de sols suivant les triangles des textures USDA, UK, Canada et FAO (international) + 7 autres systèmes. Il permet aussi d'afficher des graphiques de triangles de textures simples dans 2 géométrie différentes (mais beaucoup moins avancé que "The Soil Texture Wizard"). (publié dans deux articles de "Communications in Soil and Plant Analysis", 1996 et 2003).

— TRIANGLE, "A Program For Soil Textural Classification", de Aris Gerakis et Brian Baer, permet de classifier des sols suivant le triangle USDA (publié dans SSSAJ en 1999).

— r.soils.texture is a [Grass-GIS http://grass.osgeo.org/] add-on for classifying raster files of soil textures with 3 classification systems (USDA, FAO, ISSS). Note that this is not R code.

Articles relatifs aux triangles des textures :

— Richer de Forges A., Feller C., Jamagne M. & Arrouays D., 2008, "Perdus dans le triangle des textures" (Études et Gestion des Sols, 15:2, pp. 97-111) présente une galerie de 29 triangles des textures, actuels et anciens, de France et d'autres pays, et compare la localisation des limites de classes de textures entre plusieurs triangles. L'article présente aussi un tableau comparatif avec les limites de tailles de particules des fractions argiles, limon et sable de nombreux systèmes/pays. Voir aussi ce poster en anglais. Le travail de comparaison a été réalisé avec un "système d'information géographique" (ArcGIS ?).

— B. Minasny and A.B. McBratney. The australian soil texture boomerang : a comparison of the australian and usda/fao soil particle-size classication systems. Australian Journal of Soil Research, 39:1443—1451, 2001. LINK.

Développements futurs (ou non)

Le développement du jeu de fonctions "The Soil Texture Wizard" c'est appuyé sur les besoins en termes de manipulation de données de textures de sol que j'ai pu rencontrer dans mon travail (thèse, PostDoc), ainsi que sur un investissement personnel conséquent pour en faire quelque chose d'utilisable par d'autre utilisateurs.

Mon travail actuel impliquera beaucoup moins (ou pas) de données 'internationales' sur les textures de sol, et mon investissement personnel sur ces fonctions va aussi se réduire fortement...

Outre un classique travail de débuggage, Les développements futurs possibles sont :
Enregistrement de "The Soil Texture Wizard" comme un "package" dans "La forge R" ;
Rédaction d'une "aide intégrée" comme il en existe pour la plupart des fonctions R ;
Amélioration du tutoriel existant ;

Au delà, il vous faudra considérer de faire vous même les éventuels développements !

Contact, licence, crédits et (absence de) garanties

Contact :

Vous pouvez me contacter, signaler une erreur ou une imprécision en écrivant à l'adresse suivante :

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[les parties "images" de cette adresse doivent être copiées "à la main" ! (astuce anti-spam...)]

Copyleft : Julien MOEYS

Licence de l'article et du tutoriel :

Cette création par Julien MOEYS est mise à disposition selon les termes de la licence Creative Commons Paternité-Partage des Conditions Initiales à l'Identique 3.0 Unported.

Autrement dit, vous êtes libres de copier et distribuer cet article et le tutoriel présenté ici, de les modifier, voir de les inclure dans une prestation commerciale, à trois conditions : citer d'une manière ou d'une autre l'auteurs, maintenir les documents et ses modifications sous leur licence originale, et, en cas de modifications, signifier d'une manière ou d'une autre que des modifications on été portées au document original. En cas de modifications, le nom du document ou du jeu de fonction doit aussi être changé de manière à ce qu'il soit clair qu'il ne s'agit pas du travail original.

Licence des fonctions R :

L'ensemble de fonctions R présentées ici, sou le nom "The Soil Texture Wizard" est sous Licence Générale Publique GNU version 3 (GNU General Public License version 3).

Garanties :

Les fonctions R et les documents présentés ici ont été conçu avec soin, mais, compte tenu de la gratuité et des termes extrêmement permissifs de la licence, l'auteur ne présente aucune garantie d'exactitude des données présentées ici, et décline toute responsabilité quand à l'utilisation qui pourrait en être faite.

Affiliations :

L'auteur de ces documents est actuellement employé par l'Université Agricole de Suède (SLU : Swedish Agricultural University), a été employé dans l'unité "Environnement et Grandes Cultures" (EGC, Grignon, France) et est membre de l'Association Française d'Etude des Sols.

Ce travail n'engage pas la responsabilité de l'Université Agricole de Suède (SLU : Swedish Agricultural University).

PhD thesis now online

Julien Moeys — 2009-07-23T15:23:41Z

Reference: Moeys, J., 2007. [Spacial variability and agro-pedological determinisms of an herbicide fate in the surface horizon - an application to isoproturon in an agricultural catchment of the "Beauce chartraine" region, France] Variabilité spatiale et déterminismes agro–pédologiques du devenir d'un herbicide dans l'horizon de surface – Application au cas de l'isoproturon dans un secteur agricole de Beauce chartraine. PhD thesis, Soil Science. AgroParistech, Paris. 273 pp. + annexes.

Version française | French version

PhD thesis online (pdf)
title
thesis committee
keywords
abstract
research unit
contact

Title

«Spatial variability and agro–pedological determinisms of an herbicide fate in the topsoil – an application to isoproturon, in an agricultural area of the 'Beauce chartraine' region, France».

PhD defense committee

Mr. Rafael ANGULO-JARAMILLO	ENTPE	Assessor
Mr. Guy SOULAS	INRA	Assessor
Mme Liliane BEL	AgroParisTech	Examiner
Mr. Dominique KING	INRA	Examiner
Mr. Ludovic LOISEAU	AFSSA	Examiner
Mr. Yves COQUET	AgroParisTech	PhD supervisor

Keywords

Soil, Herbicide, Isoproturon, Spatial variability, Determinisms, Adsorption, Degradation, Hydraulic properties, Immobile water fraction

Abstract

Diffuse pollution of groundwater bodies by pesticides is a critical environmental issue. Approaches designed to spatially modulate the applied pesticide dose, as a function of pesticide leaching risks down the soil, seem to be appealing solutions. In a research context, such approaches require a mapping of soil hydropedologic properties and of pesticides adsorption and degradation properties, in order to be able to model molecules fate in soils. The PhD work presented here deals with the first step of such approach: the characterisation of soils properties and an herbicide molecule isoproturon fate properties in soil at the scale of a 2600 ha agricultural area in the Beauce chartraine region.

The PhD objectives hold in 3 parts: [i] characterising the spatial variability of soils pedological, physico-chemical and hydraulic properties (water retention, hydraulic conductivity KSAT, immobile water fraction fIMM), as well as isoproturon adsorption (KD) and degradation (DT50) properties in the topsoil of the studied area; [ii] Identify the agronomical and/or pedological determinisms of properties that are important for pesticides fate in soils; [iii] Calibrate and test pedotransfer classes or functions in order to predict important properties using simpler agronomical and/or pedological properties.

Soils in the studied area have intermediate thickness and are derived from an aeolian loess that stands on a frost cracked and cryoturbed limestone. The topsoil of 34 sites has been characterised, with a systematic measurement of the seedbed properties, and a partial measurement of the rest of the cultivated layer. Among the 50 layers / samples that were characterised, one-third holds in no-tillage fields. With the exception of bulk density, soil physico-chemical properties are moderately variable (notably clay and CaCO3 contents). If the water holding properties and isoproturon KD are moderately contrasted too, soil fIMM, and KSAT, as well as isoproturon DT50 are highly variable. An important ‘method effect' has been identified when treating the measurements results of these two last variables. A ‘robust' direct fitting procedure has been established for KSAT computation, and a direct fitting procedure has been applied for DT50 estimation. This last method does not solve the critical lack of correspondence between a degradation kinetics that was indeed biphasic and the first order equation used by pesticide fate models.

A close look at the statistical relations that exist between variables with both parametric and non-parametric methods revealed coherent but weak links (and thus potentially determinisms) between the variables: an important part of the spatial variability is not explained by the measured agro-pedological variables. The impossibility of calibrating local classes or pedotransfer functions with a satisfying prediction error arises as a logic, but problematic, consequence of this ‘undetermined' variability of soils and isoproturon fate variability. It is only possible to consider a KD or KOC prediction. It does not seems to be possible to predict – and so to spatialize – the other important properties influencing isoproturon fate in the topsoil of the studied area, using the measured properties together with the statistical analysis tested.

Laboratory

This PhD work was done in the soil team of the Environment and Arable Crops (fr:EGC) research unit (1091 INRA / AgroParisTech), in Thiverval-Grignon, under the supervision of Yves Coquet (Pr. AgroParisTech)

For any information, you can contact me at the following address:

jules

-website

oo.fr

PS: The e-mail address has to be reconstituted with both text and images above (Stop spam tips).

Thèse en ligne

Julien Moeys — 2009-07-23T15:18:40Z

Référence : Moeys J., 2007. Variabilité spatiale et déterminismes agro–pédologiques du devenir d'un herbicide dans l'horizon de surface – Application au cas de l'isoproturon dans un secteur agricole de Beauce chartraine. PhD thesis, Soil Science, AgroParisTech, Paris. 273 pp. + annexes.

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Titre

« Variabilité spatiale et déterminismes agro–pédologiques du devenir d'un herbicide dans l'horizon de surface – application au cas de l'isoproturon dans un secteur agricole de Beauce chartraine ».

Composition du jury

M. Rafael ANGULO-JARAMILLO	ENTPE	Rapporteur
M. Guy SOULAS	INRA	Rapporteur
MME Liliane BEL	AgroParisTech	Examinateur
M. Dominique KING	INRA	Examinateur
M. Ludovic LOISEAU	AFSSA	Examinateur
M. Yves COQUET	AgroParisTech	Directeur de thèse

Mots clefs

Sol, Eau, Herbicide, Agricole, Variabilité spatiale, Pollution diffuse, Propriétés physico-chimiques, Propriétés hydriques.

Résumé :

La pollution diffuse des nappes phréatiques par les pesticides pose un problème environnemental critique. Les approches visant à moduler spatialement la dose de pesticide apportée en fonction des risques de transfert des molécules phytosanitaires à travers le sol sont a priori une solution séduisante. Dans un cadre de recherche, ces approches requièrent une connaissance spatialisée des caractéristiques hydropédologiques du sol, de l'adsorption et de la dégradation des molécules phytosanitaires, afin de pouvoir modéliser le comportement des molécules. Le travail de thèse présenté ici porte sur la première étape d'une telle démarche, la caractérisation des propriétés du sol et d'une molécule herbicide – l'isoproturon – à l'échelle d'un secteur agricole de 2600 ha de Beauce chartraine.

Les objectifs de la thèse se décomposent en 3 parties : [i] Caractériser la variabilité spatiale des propriétés pédologiques, physico-chimiques et hydriques du sol (rétention en eau, conductivité hydraulique KSAT, fraction d'eau immobile fIMM), ainsi que les propriétés d'adsorption (KD) et de dégradation (DT50) de l'isoproturon dans l'horizon de surface du secteur agricole étudié ; [iii] Identifier les déterminismes agronomiques et/ou pédologiques des propriétés importantes pour le comportement des pesticides dans les sols ; [iv] Établir et tester des classes et des fonctions de pédotransfert permettant de prédire ces propriétés déterminantes à partir de propriétés agronomiques ou pédologiques plus simples.

Les sols de ce secteur sont des sols moyennement épais développés dans un limon éolien reposant sur un calcaire gélifracté et cryoturbé. L'horizon de surface de 34 sites a été caractérisé, avec une détermination systématique des propriétés du lit de semence, et une détermination partielle du reste de l'horizon travaillé. Sur les 50 couches / échantillons de sol caractérisés, un tiers se trouvent dans des parcelles en travail simplifié (sans labour). À l'exception de la masse volumique apparente, les propriétés physico-chimiques du sol sont peu variables (teneur en argile et en CaCO3 notamment). Si les propriétés de rétention en eau et le KD de l'isoproturon sont, elles aussi, modérément contrastées, la fIMM, la KSAT, et la DT50 de l'isoproturon sont très variables. Un ‘effet méthode' conséquent a été identifié pour l'interprétation des résultats des mesures de ces deux dernières propriétés. Une procédure d'ajustement direct ‘robuste' des données d'infiltration a été mise au point pour calculer le KSAT, ainsi qu'une procédure d'ajustement direct des données de dégradation pour le calcul de la DT50 de l'isoproturon, mais elle ne résout pas l'inadéquation critique entre la cinétique de dégradation ‘effectivement' biphasique observée pour la molécule et le modèle d'ordre 1 utilisé par les modèles pesticides. Une étude attentive des liens statistiques entre les propriétés par des méthodes paramétriques et non-paramétriques révèle des liens (et donc des déterminismes potentiels) cohérents mais peu marqués entre les propriétés : une part importante de la variabilité spatiale n'est pas expliquée par les propriétés agro-pédologiques mesurées. La conséquence logique, mais problématique, de cette variabilité ‘indéterminée' des propriétés du sol et de l'isoproturon est l'impossibilité d'établir des classes ou des fonctions de pédotransfert locales avec une erreur de prédiction satisfaisante. Seule la prédiction du KD, ou du KOC, peut être envisagée. Avec les propriétés mesurées et les méthodes d'analyse testées, il ne semble pas possible de prédire - et donc de spatialiser – les autres propriétés importantes pour le devenir de l'isoproturon dans l'horizon de surface de ce secteur.

Laboratoire d'accueil

Cette thèse a été effectuée dans l'équipe sol de l'UMR Environnement et Grandes Cultures (UMR 1091 INRA / AgroParisTech), à Thiverval-Grignon, sous la direction de Yves Coquet (Pr. AgroParisTech)

— - Pour plus d'information vous pouvez me contacter à l'adresse suivante :

jules

-website

oo.fr

PS : Il faut reconstituer l'adresse mail avec le texte et les images ci-dessus (Astuce anti-spam).

But where are these Soil Science researchers?

Julien Moeys — 2008-11-20T22:21:47Z

Last update (article): 27/11/2008.

Table of content

Pre-defined maps (sorted by geographical area);

Text version of the directory;

Import the directory as html/Netscape bookmarks format;

Read the map directly from Google Maps;

Download the directory in Google Earth format (.kmz); [4]

Download the directory in spreadsheet format (.CSV);

How to obtain UTM coordinates of a location with Google Maps;

Contact, point out mistakes, add a laboratory;

About this document (terms of use).

R Scripts/code used to produce the KML and HTML files.

Pre-defined maps

Geographical areas:

World (beware, some placemarks might be "hidden" near the border of the map: center the map on the area that interest you and use the zoom if necessary);

France, Belgium, Luxembourg and Switzerland;

USA and Canada;

Germany, the Netherland, Belgium and Luxembourg;

Australia and New Zealand;

Scandinavia and Baltic states (Norway, Sweden, Denmark, Estonia, Latvia, Lithuania).

Notes:

Placemarks are presented as arrows on top of a map. Click on an icon to obtain a short description of the laboratory;

Placemarks are sorted and grouped (1) by countries and (2) by cities. These grouping are essential to improve the map readability, avoiding masking problems when a placemark overlap another one at coarse scales;

If several laboratories are in the same city, they are grouped into one unique placemark, placed at the geographical "barycenter" of the different laboratories. To see the precise location of one of the laboratories, click on placemark, and then click on "[map]", on the right of the lab description;

On some maps, at small scales (large areas), some placemarks can overlap other neighbour placemarks, when located in nearby cities. Zoom-in to obtain more details.

Import the directory as html/Netscape bookmarks format

The following page is in html/Netscape bookmarks, and thus can be imported in Mozilla-Firefox or Microsoft-Internet Explorer as internet bookmarks. With Firefox: File > Save as ..., and then Bookmarks > Organise bookmarks > Import. This page will be saved in a spacial folder, and sorted in several sub-folders (by countries). This page can also be displayed as any other internet page (html).

How to obtain UTM coordinates of a location with Google Maps

It is possible to know the geographical coordinates of a location with Google Maps. Many other software and websites allow this, but in this precise case it is probably better to do it with Google maps in order to avoid (risks of) problems related to conversions between different coordinate systems.

Go to Google Maps;

Search on the map the location of your institution, using the arrows and the zoom on the left of the map. Zoom at the maximum resolution for the targeted location;

Do a right mouse-click on the map at the precise location of your institution. Choose "center map here";

Click on the "link" button on the top-right corner of the map. A dialog box appear, with two sub-parts. Copy the first (not the HTML code);

Open a text editor (Notepad, Open-Office, ...), and paste the link previously copied; It looks like this: http://maps.google.com/?ie=UTF8&ll=48.846471,1.943641&spn=0.000591,0.000929&t=h&z=20, with often some extra text.

[For those who just want the coordinate of their lab for the directory, the full link can be send to me directly]

Find in this mess the characters &ll=. It is followed by two figures (ex. &ll=48.846471,1.943641): Latitude (ex. 48.846471) and longitude (ex. 1.943641), in UTM (Beware that there is also an &sll= markup, that should not be used here).

Contact, point out mistakes, add a laboratory

You can point out mistakes, some inexact information or propose a new soil-science laboratory address by writing to the following address:

jules

-website

oo.fr

[the image parts of the e-mail address can't be copied and must be typed! It is a tip to prevent spam...]

Required information is:

Name of the institution (or, alternatively, of the department, the laboratory or the research team);

Geographical coordinates: Latitude (positive in the north and negative in the south) and Longitude (positive at the east of Greenwitch meridian and negative at the west), in the UTM system. See above to know how to retrieve these coordinates.

Name of the "main" institution: (optional) Name of the institution or university to which the soil-science research cluster belongs. If several institutions are involved, prefer shortabbreviation rather than full names;

Complementary information: (optional) Name of the department (for a lab), of the lab (for a research team), or original/non-English name, or very brief description etc. ...

City: City in which (or nearby which) is the soil-science research cluster;

Country

NB: Given the fact that the directory is realised voluntarily (for free), if requested changes are late, be patient...

About this document

Version: 0.5β.

Copyleft: Julien MOEYS

Licence:

This work by Julien MOEYS is licensed under a Creative Commons Attribution-Share Alike 3.0 Unported License.

In other words, you are free to copy and distribute the repository and the associated documents presented here, to modify them, and even to include them in a commercial service [5], if three conditions are respected: citing in a way or another the author, maintain the documents and their modification under their original licence and, in case of modification, underline in a way or another that the original document has been altered.

Google Maps qnd Google Earth are Trade Marks (™) of Google Inc. Google offer these two services for free. The author is not affiliated with Google.

Guarantees: The directory presented here has been designed and populated with care, but, given the extremely permissive terms of the licence, the author do not assume any responsibility of correctness for the data presented here, and waives any responsibility for uses that could be done with it. This directory centralise public data, that can, be found easily on internet and that are widely distributed: The web address (url) of the laboratory, ands their geographic location (which is derived from their postal address, and/or from direction maps provided on institutions websites.

Affiliation: The author is presently (2008/11/20) employed by the Swedish University of Agricultural Sciences (SLU: Sveriges lantbruksuniversitet), has been employed in the "Environment and Arable Crop" research unit (EGC, Grignon, France) and is a member of the French Association for Soil Science.

Technical stuff: The "database" of this directory is in fact a simple speadsheet, produced with Google Documents™, which eventually allows a collaborative / multi-site work. This spreadsheet is exported as a .CSV file, and then converted in .KML format ([which specification are presented here>http://code.google.com/apis/kml/documentation/kmlreference.html]), compressed .KML (that is .KMZ) and in html/Netscape bookmarks file format, through a script/a function written with the R statistical programming language (This language is not designed for this purpose, but it is broad-enough to do the job honourably!).

R Scripts/code used to produce the KML and HTML files

The code/script of the R functions used to produce the KML, KMZ and HTML/bookmarks is now (2009/06/29) available:

code/script of R functions (.R). The code is licensed under a GNU General Public License version 3;

A short document (R "vignette") describing how to use these functions.

Mais où sont ces chercheurs en Science du Sol ?

Julien Moeys — 2008-11-11T13:30:36Z

Dernière actualisation (article) : 21/11/2008.

Sommaire

Consulter les cartes pré-définies (par aires géographiques) ;

Consulter le répertoire au format texte ;

Importer le répertoire au format marques-pages html/Netscape ;

Consulter directement le répertoire depuis Google Maps ;

Télécharger le répertoire au format Google Earth (.kmz) ; [6]

Télécharger le répertoire au format tableur (.CSV) ;

Comment obtenir les cordonnées UTM d'un emplacement avec Google Maps ;

Contacts, signaler une erreur, ajouter un laboratoire ;

A propos de ce document (conditions d'utilisation) ;

Scripts/code R utilisé pour produire les fichiers KML et HTML.

Cartes des laboratoire

Aires géographiques :

Monde (attention, certains signets peuvent être masqués près des bords de la carte : centrez cette dernière sur le secteur qui vous intéresse, et utilisez le zoom si besoin) ;

France, Belgique, Luxembourg et Suisse ;

États Unis et Canada ;

Allemagne, Pays-Bas, Belgique et Luxembourg ;

Australie et Nouvelle-Zélande ;

Scandinavie et Pays Baltes (Norvège, Suède, Danemark, Estonie, Lettonie, Lituanie).

Notes :

Les géo-signets sont présentés sous forme de flèches sur les cartes. Cliquez sur les icônes pour obtenir une description des laboratoires.

Les géo-signets sont triés et regroupés (1) par pays et (2) par ville. Ces regroupements ont essentiellement pour but d'améliorer la lisibilité des cartes, en évitant les problèmes de "masquage" d'un signet par un autre ;

Si plusieurs laboratoires sont présents dans une même ville, ils sont regroupés sous un seul signet, placé au "barycentre" géographique des différents laboratoires. Pour connaître la localisation précise d'un des laboratoire, cliquez sur "[map]" à côté de l'adresse ;

Sur certaines cartes à petite échelle (aire géographique importante), les signets peuvent se superposer, avec des signets "supérieurs" masquant des signets "sous-jacents". Le regroupent par ville évite une partie des récouvrement, mais pas toujours (localités "proches"). Zoomez sur l'aire qui vous intéresse pour obtenir plus de détails.

Importer le répertoire au format marques-pages html/Netscape

La page suivante est au format de marques pages html/Netscape, et peut donc être importée dans Mozilla-Firefox ou Microsoft-Internet Explorer sous forme de marques pages internet. Avec Firefox, Fichier > Enregistrer..., puis Marques pages > Organiser les marques pages > Importer. Ces marques pages sont contenus dans un dossier général et répartis dans plusieurs sous-dossiers (pays). Cette page peut aussi être consultée comment n'importe quelle page internet (html).

Comment obtenir les cordonnées UTM d'un emplacement géographique avec Google Maps

Il est possible de connaître les coordonnées géographiques d'un emplacement avec Google Maps. De nombreuses autres applications permettent cela, mais dans ce cas précis, il est préférable de le faire avec Google Maps pour éviter les (risques de) problèmes de conversions d'un système à un autre.

Rendez vous sur Google Maps ;

Rechercher sur la carte l'emplacement de votre institution, en jouant avec les flèches et le zoom à gauche de la carte. Zoomez au maximum sur l'emplacement visé ;

Effectuez un clic droit sur la carte à l'emplacement précis de l'institution. Choisir "centrer la carte ici" ;

Cliquez sur le bouton "lien" en haut à droite de la carte. Une boite de dialogue apparaît, avec deux parties. Copier la première (pas le code HTML) ;

Ouvrez un logiciel de traitement de texte (Notepad, Open-Office...), et collez y le lien précédemment copié ; Cela ressemble à ceci : http://maps.google.com/?ie=UTF8&ll=48.846471,1.943641&spn=0.000591,0.000929&t=h&z=20, avec souvent quelques éléments en plus.

[Ceux qui veulent juste ajouter les coordonnées de leur laboratoire au répertoire peuvent ce contenter de m'envoyer ce code]

Repérez dans ce charabia les carcatères &ll=. Il est suivit de 2 chiffres séparés par une virgule (ex. &ll=48.846471,1.943641) : La latitude (ex. 48.846471) et la longitude (ex. 1.943641) (Attention, il existe aussi une balise &sll= qu'il ne faut pas utiliser).

Contacts, signaler une erreur, ajouter un laboratoire

Vous pouvez signaler une erreur, une imprécision, ou proposer une nouvelle adresse de laboratoire en Science du Sol en écrivant à l'adresse suivante :

jules

-website

oo.fr

[les parties "images" de cette adresse doivent être copiées "à la main" ! (astuce anti-spam...)]

Les informations nécessaires sont les suivantes :

Nom de l'institution (ou, alternativement, du département, du laboratoire, de l'équipe de recherche) ;

Coordonnées géographiques : Latitude (positive au nord, négative au sud) et longitude (positives à l'est du méridien de Greenwitch, négatives à l'ouest), dans le système UTM. Voir ci-dessous pour savoir comment obtenir ces coordonnées.

Nom de l'institution de rattachement : (facultatif) Nom de l'institution ou de l'université de rattachement (niveau le plus élevé). Si plusieurs institutions sont impliquées, préférez les abréviations plutôt que les noms complets ;

Complément de l'intitulé : (facultatif) Nom du département de rattachement (pour un labo), du laboratoire de rattachement (pour une équipe), ou Nom dans la langue du pays, ou abréviation, ou nom alternatif, ou très bref descriptif, etc. ...

Ville : Ville dans laquelle (ou à proximité de laquelle) se trouve l'institution ;

Pays

Le répertoire présenté ici étant réalisé bénévolement, si les changements tardent, soyez patient...

A propos de ce document

Version : 0.5β.

Copyleft : Julien MOEYS

Licence :

Cette création par Julien MOEYS est mise à disposition selon les termes de la licence Creative Commons Paternité-Partage des Conditions Initiales à l'Identique 3.0 Unported.

Autrement dit, vous êtes libres de copier et distribuer les documents du répertoire présenté ici, de les modifier, voir de les inclure dans une prestation commerciale [7], à trois conditions : citer d'une manière ou d'une autre l'auteurs, maintenir les documents et ses modifications sous leur licence originale, et, en cas de modifications, signifier d'une manière ou d'une autre que des modifications on été portées au document original.

Google Maps et Google Earth sont des marques déposées (™) de Google Inc. Google offre ces deux services/applications gratuitement. Les auteurs ne sont pas affiliés à Google.

Garanties : Le répertoire présenté ici a été conçu avec soin, mais, compte tenu de la gratuité et des termes extrêmement permissifs de la licence, l'auteur ne présente aucune garantie d'exactitude des données présentées ici, et décline toute responsabilité quand à l'utilisation qui pourrait en être faite. Ce répertoire rassemble des données par ailleurs publiques et largement diffusées, à savoir l'adresse internet des laboratoires (url), ainsi que leur localisation géographique (dérivée de leur adresse postale et des cartes d'accès éventuellement fournies sur les sites internet).

Affiliations : L'auteur de ces documents est actuellement employé par l'Université Agricole de Suède (SLU : Swedish Agricultural University), a été employé dans l'unité "Environnement et Grandes Cultures" (EGC, Grignon, France) et est membre de l'Association Française d'Etude des Sols.

Techniques : La « base de donnée » au cœur de ce répertoire est en fait un simple tableur, produit avec Google Documents™, ce qui permet éventuellement un travail collaboratif multi-sites. Ce tableau est exporté au format .CSV, puis il est converti aux formats KML (dont les spécifications sont présentées ici) et compressé en .KMZ, puis dans un 2e temps converti au format html/Netscape bookmarks à l'aide de scripts/fonctions écrites dans le langage de programmation statistique R (Ce langage n'est pas conçu pour cet usage, mais il est suffisamment polyvalent s'en acquiter honorablement).

Scripts/code R utilisé pour produire les fichiers KML et HTML

Le code/script des fonctions R utilisées pour produire les fichiers KML, KMZ et HTML/bookmarks est désormais (2009/06/29) disponible :

code/script des fonctions R (.R) : Le code est sous licence GNU General Public License version 3

Un court document ("vignette" R) décrivant l'utilisation de ces fonctions (disponible en anglais uniquement).

Scientific jobs: Tips for improving web-based jobs search

Julien Moeys — 2008-03-24T16:22:59Z

Google Alerts

RSS feed

Useful websites

This article is licensed under a Creative Commons By-SA licence

top

Google Alerts

Google Alerts is a free service provided to Google account owners (Gmail or Google calendar users for instance. Registration is free). See Google Alert description on Wikipedia or on Google

The principle is rather simple: You can use a standard Google search to find some job positions already advertised on internet and already referenced by Google (or to find any other information already published). Nevertheless when looking for a job you need to repeat the operation often to stay informed of the last offers. Needless to say it is a long and fastidious task.

Hopefully Google Alerts service is there to memorize this search for you and to send you (on your Gmail box) the new results that match this search when they are detected by Google crawlers.

It is even possible to memorize several Alerts, thus allowing you to cover a large range of "targets". Alerts can be focused on keywords or on some specific web-pages.

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Create a Google Alert for specific keywords

Creating such an alert is relatively simple. Open you favorite browser (Firefox i hope), go to Google page, sign-in (top-right corner), jump to Google Alerts service and fill the form as below:

details:

Search terms: (phd OR postdoc OR postdoctoral) AND (position OR fellowship OR Job) AND soil;
Type: Comprehensive;
How often: as-it-happens;
Your email: ...

The "Search terms" must be customized to meet your job-search goals (which may not be related to soils!). Use the standard Google search engine to ensure that the search terms you use are both relevant and precise (use the number of relevant search result as an indicator for this).

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Create a Google Alert for a specific site

For Google Alerts, as for normal Google search, there is a useful tip to target a specific site or a specific web-page. Nevertheless, RSS feed are certainly the best and easiest solution to stay informed of changes in a website content. When RSS feed is not available, Google Alerts can help you.

Just create an Alert with Search terms including the "site:" keyword, following a pattern like :

Search terms:

site:http://www.thetargettedsite.org/thetargettedpage.htm

A real example could be:

site:http://www.inra.fr AND position AND soil

site:http://www.pedometrics.org/pm/?cat=4

([21/11/2008] This last example is now outdated as pedometrics.org website has now RSS feed!)

NB:There should NOT be ANY space character between "site:" and the site url.

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You also have to know that:

On the one hand, broad "Search terms" have good chances to result in numbers of non-relevant results (that you will receive in your Gmail account);
On the other hand, very narrow "Search terms" have good chance to "miss" some interesting new results for you. Job vocabulary is not universal.
Results also depend on the frequency at which Google update websites. Small audience websites will not be visited often by Google crawlers. This might delay the time for you to get the alerts. It is possible to know the last time Google updated a web page, using a standard search: On a Google search results page, on the bottom of a link description, right of the green url, you can find the "- Cached -" link: This redirect you on the page as it is memorized by Google. The last update time is written on the first line.
This kind of web-based job search reveals the "postdoc and/or web-culture" geography: In soil science, positions from United States are from far the more numerous, at least among web-visible offers. Europe come only in a second position, and France is relatively minor (but things might change in the future, at least for the web-visibility).
If you don't want to use Google Alerts, it is still possible to use an Advanced Search that allows you to restrict search results to the most recent items, as shown in this example;
Sometimes job offers "fishing" catch some largely outdated items, especially when some website reorganize or archives part of their content. So always check offers expiration date...

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Avoid spamming/spamdexing:

[added 21/11/2008]

The problem:

I noticed over the last month a significant increase of non-relevant Google alerts results, including a significant number of "hit" furiously looking like "spam". After a small Google search I realised that these problems are widespread and called "Spamdexing". It is often carried by blogs which comments are filled by spam-advertising, or even by blog created in purpose by spammers. In the last case, the blog is filled with some "keywords" or part of real web-pages copied elsewhere!

The solution:

Hopefully the solution is fairly simple! You just need to add a few well defined keywords that should NOT be matched by the research query, preceded by a "minus" character in your search request. For instance it can be:

-blog -dentist -medicine

The overall search string is then (for instance):

(phd OR postdoc OR postdoctoral) AND (position OR fellowship OR Job) AND soil -blog -dentist -doctor -medicine

Why these anti-keyworks "-dentist", "-medicine" etc. etc.

Because a significant number of spam I received in Google Alert concerned dentists lists or websites selling medicines!

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RSS feed

RSS feed is quite a barbarian name for a really cool technology. It allows you to stay informed of new "posts" or "articles" in a given website, without requiring to subscribe to a mailing list. Information became easily accessible, but you choose when and where you want to see them in details. See RSS feed description on Wikipedia

Even if you don't use RSS, you have necessarily seen RSS somewhere, as many websites now provides this service (and CMS such as Spip do that for you). Remember:

When you click on that icon, you arrive on the page with a relatively "raw" presentation...

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If you want to retrieve RSS with Firefox live bookmarks

After reaching an RSS page, the subscription is fairly simple:

Choose "Subscribe to this feed using: Live Bookmarks" ("Live Bookmarks" are the implementation of RSS feed as self-uptdated bookmarks);
Clic on "Subscribe now";
The "Add live bookmark" dialog-box appear. Eventually choose another name for the bookmark and ;
precise the bookmark folder for this feed. Choosing the the bookmark toolbar will allow you to check regularly new updates in this feed if you enabled Firefox bookmark toolbar.

This bookmark is then displayed in your bookmark toolbar. When you click on it, instead of opening a webpage, you have this:

This allows you to check quickly the new posts on this webpage without loading completely. Very useful!

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If you want to retrieve RSS with Thunderbird mailbox

I will not illustrate the procedure for Thunderbird as for Firefox.

As for Firefox you must first copy the address of the RSS feed you want to include in Thunderbird.

You must first create an "RSS News & Blogs" account in Thunderbird. In the menu bar, click on "Tools" > Then click on "Account settings".

The "Account settings" box appear > Click on the "Add account..." button on the bottom-left of the dialog box > Another dialog box appears, choose "RSS News & Blogs" Option > Next (name the box, in my case "RSS") > Finish.

Now you have an RSS ready box in Thunderbird. It should appear in the left-pane list of accounts.

Right-click on it > choose "Subscribe..." > In the dialog box click on the "add" button > Paste the address you previously copied in the "Feed URL" field, and name this subscription > Click on "OK". Thunderbird load the RSS feed, and you can then close the dialog box. The feed is now visible on your "RSS box" on the left pane (if not, click on it)

New post on the RSS feed now arrive in this box exactly as mails in a normal mailbox!

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RSS when using Microsoft Explorer or Outlook

Microsoft provides some help pages for RSS for those using Internet Explorer or Outlook. Notice that scripts must be enabled for the second page because they want to see "if a 2007 Microsoft Office program is installed" (no comments).

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Relevant job sites for the position you are looking for

Now that you know how to use RSS feed its necessary to find job-offer websites that provide this service!

I maintain a list with useful websites for scientific jobs. Not all of them provide RSS feeds, but its a good start.

[21/11/2008] :: I have created a geographical directory of soil science research laboratories in the world. In this directory, research unit are presented on maps. It is not comprehensive but it is already quite big.

Some of them are more specific to agriculture or earth sciences:

The ASABE Career Center (American Society of Agricultural and Biological Engineers);

Earthworks Jobs. Jobs in all fields of Earth Sciences;

GeogJobs. Geography and Earth Science jobs;

The Eggs Job positions. "The Egg" is the EGU (European Geosciences Union) Newsletter.

If the sites provided above are not relevant for you, there are good chances that the Google Alerts you set-up redirect you on offers advertised by job websites that are relevant for your needs. Look at them, and check if the provide RSS feeds...

As for Google Alerts the results of RSS feed are sometimes "too abundant" but "not relevant", so choose them carefully or refine they use by using Thunderbird "message filters" capabilities.

Now good luck!

For any information, you can contact me at the following address:

jules

-website

oo.fr

PS1: The e-mail address has to be reconstituted with both text and images above (Stop spam tips).

PS2: Remarks about this article are always welcome. Although this article has been written with care, its content is given for free, "as is", without any guarantee, neither with "customer" service.

This article is licenced under a
Creative Commons By-SA 3.0 Licence
(Creative Commons Attribution-Share Alike 3.0 Licence, or further version of the licence)

In short: you are free to copy, distribute and modify the article content, including for commercial services and without asking the author permission, BUT you have to cite the author (Julien MOEYS) somewhere and preserve the article original license.

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Emploi scientifique : Astuces pour améliorer sa recherche d'emploi sur internet

Julien Moeys — 2008-03-24T16:22:47Z

Les Alertes Google

Les flux RSS

Sites internet utiles

Cet article est publié sous licence Creative Commons By-SA

Avertissement : bien que cet article soit réalisé en français il faut souligner que les résultats de la "pêche" aux offres d'emploi sont plutôt maigres quand on se limite aux offres publiées en français. Les lecteurs sont donc invités à consulter la version anglaise de cet article, au moins pour réutiliser les mots clefs anglais proposés pour cette recherche.

haut

Les Alertes Google

Les Alertes Google sont un service gratuit fournit aux détenteurs d'un compte Google (pour Gmail ou le Calendrier Google par exemple. Le service est gratuit). Pour plus de renseignement, voyez la description des Alertes Google sur Wikipedia (en anglais, l'article français n'existe pas) ou sur Google.

Le principe est relativement simple. Vous pouvez utiliser une recherche Google "classique" pour trouver des offres d'emploi déjà publiées sur internet et déjà référencées par Google. Néanmoins, dans le cadre d'une recherche d'emploi, il faut répéter cette recherche fréquemment pour rester informé des dernières offres. C'est peu dire que cette tache est longue et fastidieuse.

Mais heureusement les Alertes Google sont là pour mémoriser cette recherche et vous envoyer (sur votre boite Gmail) les nouveaux résultats qui répondent à cette recherche quand ils sont détectés par les "robots d'indexation" de Google.

Il est même possible de mémoriser plusieurs Alertes Google, ce qui permet de couvrir un panel de "cibles" plus large. Les alertes peuvent être spécifiées sur des mots clef et/ou sur des sites (ou des pages internet) spécifiques.

haut

Créer une Alerte Google sur des mots clefs

Créer une alerte sur mot(s) clef(s) est relativement simple. Ouvrez votre navigateur internet favori (J'ose espérer Firefox), puis la page d'accueil Google, "connectez" vous (en haut à droite), puis rendez vous sur la page des Alertes Google et remplissez le formulaire ci-dessous :

détails :

Termes recherchés : ("bourse de thèse" OR "offre de thèse" OR "contrat de thèse") sol ;
Type : tous les types ;
Fréquence : selon l'actualité ;
Email : ...

Il est bien sur nécessaire de d'adapter les "termes recherchés" pour qu'ils répondent à votre recherche d'emploi (qui peut être n'est pas liée au sol !). Utilisez le moteur de recherche Google classique pour vous assurer que les termes recherchés sont à la fois pertinents et précis (considérer la proportions de résultats satisfaisants comme un indicateur).

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Créer une Alerte Google sur un site spécifique

Comme pour la recherche Google "classique", il existe une astuce pour cibler un site (ou une page internet) particulier(e) avec les Alertes Google. Cependant, en dehors des Alertes Google, les flux RSS sont certainement la meilleure et la plus simple des solutions pour rester informer des changements de contenu d'un site. Mais quand les flux RSS ne sont pas disponibles, les Alertes Google peuvent vous aider.

Il suffis de créer une alerte dont les "termes recherchés" incluent le mot clef "site:", en suivant le modèle suivant :

Termes recherchés :

site:http://www.lesitevise.fr

ou alternativement :

site:http://www.lesitevise.fr/lapagevisee.htm

Un exemple réel pourrait être :

site:http://www.inra.fr bourse "post doc" recrute

site:http://www.pedometrics.org/pm/?cat=4

([21/11/2008] Cet exemple est maintenant obsolète, le site pedometrics.org ayant mis en place in fil RSS !)

NB : Il ne doit PAS y avoir d'espaces entre "site:" et l'url du site.

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Bon à savoir :

Autant des termes recherchés "larges" risquent de donner de nombreux résultats non pertinents (que vous recevrez sur votre boite Gmail)... ;
...autant des termes recherchés "restreints" risquent de "rater" des résultats qui auraient pu vous intéresser. La terminologie de l'emploi n'est pas universelle ;
Les résultats dépendent aussi de la fréquence à laquelle Google visite les sites d'intérêt. Les sites ayant une audience plus faible seront visités moins fréquemment par les "robots" de Google. Cela peut induire un délai entre la publication d'une annonce et la réception d'une alerte sur celle-ci. Il est possible de savoir la date de la dernière visite de Google sur une page internet : Sur la page de résultats d'une recherche Google classique, en bas de la description d'un lien, à droite de l'url verte, on peut trouver le lien "- En cache -" : Il redirige vers la page telle qu'elle a été mémorisée par Google. La date de la dernière mise à jour est sur la première ligne.
Cette méthode de recherche d'offres d'emploi reflète d'une certaine manière la géographie des PostDoc et/ou de la culture Internet : En science du sol, les offres en provenance des États Unis sont de loin les plus nombreuses, au moins pour la partie "visible" sur la toile. L'Europe arrive seulement en 2e position, et les offres provenant de France sont relativement peu nombreuses (mais pas absentes. Ce constat pourrait bien évoluer dans un futur proche, au moins pour ce qui est de la "visibilité" des offres sur la toile) ;
À défaut d'utiliser les Alertes Google, il est possible de se contenter d'une recherche avancée qui permet notamment de restreindre les résultats d'une recherche aux éléments les plus récents, comme le montre cet exemple ;
Il arrive aussi que la la "pêche" aux offres d'emploi remonte quelques "carcasses" largement périmées, notamment lorsque certains sites internet réactualisent ou archivent une partie de leur contenu. Vérifiez bien les dates d'expiration des offres avant de sauter de joie...

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Éviter les pourriels/spams et le spamdexing :

[ajout du 21/11/2008]

Le problème :

J'ai remarqué ces derniers mois une augmentation non-négligeable de résultats "non-pertinents" dans mes Alertes Google, y compris une quantité de résultats ressemblant furieusement à du spam. Après une petite recherche sur Google je me suis rendu compte que ce problème est assez répandu est répond au nom barbare de "Spamdexing". Ces spams sont souvent véhiculés par des blogs dont les commentaires sont remplis de "publicités", voir même de blogs crées tout spécialement par des spammeurs. Pour ces derniers, le blog est rempli de "mots-clefs" divers et variés, voir d'extraits de page internet réelles, copiées ailleurs !

La solution :

Heureusement la solution est assez simple ! Il "suffis" d'ajouter quelques mots-clefs soigneusement choisis que la requête ne devra PAS rapporter, précédés du caractère "moins". Cela peut par exemple être :

-blog -dentist -medicine

Soit pour une requête complète (par exemple) :

("bourse de thèse" OR "offre de thèse" OR "contrat de thèse") -blog -dentist -medicine

Pourquoi ces mots clefs "-dentist", "-medicine" etc. etc.

Parce que j'ai reçu un bon nombre de spams sur Google Alert qui concernaient des listes de "dentist" ou des sites de vente de médicaments ("medecines") !

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Les flux RSS

Malgré leur nom assez assez barbare, les "flux RSS" [8] sont une technologie sympathique. Ils vous permettent de rester informé des nouveaux articles (ou autre contenu) d'un site internet donné, sans avoir à s'inscrire à une liste mail. L'information est ainsi aisément accessible, mais vous choisissez quand et où vous la consultez. Pour en savoir plus, consultez l'article sur les flux RSS de wikipedia.

Même si vous n'utilisez pas encore les flux RSS, vous les avez nécessairement entraperçu quelque part, car de nombreux sites internet fournissent aujourd'hui ce service (et les SGC/CMS comme Spip gèrent cela pour vous). Rappelez-vous :

Quand vous cliquez sur cette icône, vous arrivez sur une page dont la présentation est assez "brute". Voir par exemple le flux suivant, sur le site GeogJobs.com.

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Recevoir un flux RSS avec les marques pages dynamiques de Firefox

Après avoir chargé la page du flux RSS, "l'abonnement" est relativement simple :

Choisir "S'abonner à ce flux en utilisant : Marque-pages dynamiques" (Les "Marque-pages dynamiques" sont une implémentation des flux RSS sous forme de marque-pages dont la mise à jour est automatisée)
Cliquer sur "S'abonner maintenant" ;
La boite de dialogue "Ajouter un marque-page dynamique" apparait. Changez éventuellement le nom du marque-page et ;
précisez le dossier de marque-pages dans lequel ranger ce flux. Choisir la "barre (de marque-pages) personnelle" permet de vérifier régulièrement les mises à jour du flux (si la barre personnelle est affichée).

Le marque-page/flux RSS est alors affiché dans votre barre personnelle (ou ailleurs dans le menu "marque-pages"). Quand vous cliquez dessus, un menu apparait (au lieu d'ouvrir une page internet), comme ceci :

Cela permet de vérifier rapidement si de nouveaux ajouts ont été apportés à une page internet, mais sans la chargée complètement. Très pratique !

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Recevoir un flux RSS dans une boite mail Thunderbird

(Je n'ai pas illustré la procédure de capture d'écran comme pour Firefox. Voyez ici pour un article sur le sujet avec des illustrations).

Commencez par copier l'adresse du flux RSS sur la page de consultation, depuis Firefox, avant de configurer Thunderbird.

Il faut tout d'abord créer un compte "Nouvelles RSS et Blogs" dans Thunderbird. Dans la barre de menu de Thunderbird, cliquez sur "Outils" > puis cliquez sur "Paramètres des comptes".

La boite de dialogue "Paramètres des comptes" apparait > cliquez sur "Ajouter un compte" > choisissez l'option "Nouvelles RSS et Blogs" > Suivant (Nommez cette boite, par exemple "RSS") > "terminer".

Vous avez maintenant une boite prête pour les flux RSS dans Thunderbird. Elle doit apparaitre dans le panneau de gauche, avec la liste de vos autres comptes mails.

Faites un clic droit sur la boite > choisissez "Gérer les abonnements..." > Dans la boite de dialogue cliquer sur le bouton "Ajouter" > Collez l'adresse du flux RSS précédemment copiée dans le champ "URL du fil", et nommez cet abonnement > cliquez sur "OK". Thunderbird charge le flux RSS, et vous pouvez maintenant fermer la boite de dialogue. Le flux RSS est maintenant visible dans la boite "RSS", du panneau de gauche (et si elle n'est pas visible cliquez sur la boite "RSS").

Les nouveaux articles du flux RSS (et donc du site connexe) arriveront maintenant dans votre boite mail, exactement comme un e-mail "classique" dans une boite mail "classique".

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Les flux RSS avec Microsoft Explorer ou Outlook

Microsoft fournit quelques pages d'aides sur les flux RSS pour ceux qui utilisent Internet Explorer (voir aussi la version anglaise, plus complète) ou Outlook. Notez qu'il est nécessaire d'activer les scripts pour cette dernière page, pour vérifier "[...] si un programme Microsoft Office 2007 est installé [...]" (sans commentaire).

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Sites internet pertinents pour trouver des offres d'emploi en science de la terre

Maintenant que vous savez vous servir des flux RSS il est nécessaire de trouver des sites d'offres d'emploi qui répondent à vos attente. Ce n'est pas la tache la plus facile !

Je gère une liste de sites internet utiles pour la recherche d'emploi scientiques. Ils n'offrent pas tous de flux RSS, mais c'est un bon début. Malheureusement pour ceux qui cherchent des offres en France ou en pays francophones, la plupart de ces sites sont anglophones...

[21/11/2008] :: J'ai crée un répertoire géographique des laboratoires de recherche en science du sol dans le monde. Ce répertoire présente les unités de recherche sur des cartes. Il n'est pas exhaustif, mais a déjà une taille respectable.

Quelques uns sont plus spécifiquement consacrés à l'agriculture ou aux sciences de la terre :

The ASABE Career Center (American Society of Agricultural and Biological Engineers) ;

Earthworks Jobs. Des emplois dans tous les domaines des géosciences/sciences de la terre ;

GeogJobs. Des emplois en géographie et en science de la terre ;

The Eggs Job positions. "The Egg" est la lettre d'information de l'EGU (European Geosciences Union/Société Européenne des Géosciences).

Du côté des emplois scientifique dans la fonction publique française on se tournera vers :

Le calendrier des concours de la fonction publique française

Le site TéleMaque, pour les "concours et examens administratifs et techniques du Ministère de l'Agriculture et de la pêche.

La page Concours, emplois et carrières du ministère de l'éducation Nationale (avec entre-autre les concours de chercheurs ou d'enseignant-chercheur).

Si les sites ci-dessus ne sont pas pertinent pour vos recherches d'emploi, il y a de bonnes chances que les alertes Google que vous mettrez en place vous dirigent vers des offres d'emploi publiées par des sites spécialisés dans les domaines qui vous intéressent. Inspectez ces sites et regardez si ils ne fournissent pas de liens RSS...

Comme pour les Alertes Google, il arrivent que les résultats des flux RSS soient "trop abondants" et donc "non pertinents". Choisissez les avec soin, ou complétez leur utilisation en utilisant les filtres de Thunderbird (ou cet autre lien plus à jour, mais en anglais).

Et maintenant, bonne chance !

Vous pouvez me contacter à l'adresse suivante :

jules

-website

oo.fr

PS1 : L'adresse mail ci-dessus doit être reconstituée manuellement en concaténant les partie de texte et le contenu des images (astuce anti-spam).

PS2 : Les remarques éventuelles sur mes articles sont bien évidemment les bienvenues. Bien que rédigé avec le plus de soin possible, le contenu est fourni à titre gratuit, sans garantie d'exactitude, ni de "service après don".

Cet article est publié sous contrat/licence
Creative Commons Attribution-Share Alike
(en français : "Paternité-Partage des Conditions Initiales à l'Identique"),
version 3.0 (ou ultérieures).

En clair : Vous êtes libres de copier, distribuer et modifier le contenu de l'article, y compris pour un usage commercial, et sans demander la permission préalable de l'auteur. PAR CONTRE vous devez mentionner l'auteur (Julien MOEYS) quelque part et vous devez préserver la licence initiale de l'article.

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PhD defence :: 20/12/2007 :: Soil & pesticide

Julien Moeys — 2007-12-05T10:41:25Z

Version française | French version

Online PhD thesis (pdf)
title
date, time and place
thesis committee
keywords
abstract
research unit
additional information

I am pleased to invite you to my PhD defence, entitled :

The PhD defense will take place the 20th of December 2007, at 14:00, in the ENGREF (AgroParisTech) building Paris, 19 avenue du Maine (200 m from the Paris–Montparnasse train station), 'amphithéâtre 7', ground floor.

It will be publicly defended, with a thesis committee compose of :

Mr. Rafael ANGULO-JARAMILLO	ENTPE	Assessor
Mr. Guy SOULAS	INRA	Assessor
Mme Liliane BEL	AgroParisTech	Examiner
Mr. Dominique KING	INRA	Examiner
Mr. Ludovic LOISEAU	AFSSA	Examiner
Mr. Yves COQUET	AgroParisTech	PhD supervisor

Keywords: Soil; herbicide; isoproturon; spatial variability; determinisms; adsorption; degradation; hydraulic properties; immobile water fraction.

Abstract :

The PhD objective is to identify the agro-pedological factors influencing a herbicide (isoproturon) fate in the surface horizon of the soils of a 2600 ha agricultural area, in the 'Beauce chartraine' region, using a characterisation of soil and isoproturon properties and their spatial variability.

The work lies within the context of diffuse pollution of water bodies by pesticides, for which identification of area presenting a higher pesticide transfer risk is a possible solution. The ability to identify the agro-pedological determinisms of these pollution and to build statistical model of the relations between ‘elementary' soil properties and pesticide fate (pedotransfer classes or functions), is essential for computing a spatialized pesticides transfer risks estimation.

The soils in the studied area have a medium depth and are developed in an aeolian silt lying on a frost-fragmented and cryoturbed limestone. The surface horizon of 34 sites has been characterised, with a systematic determination of the seedbed properties, and a partial determination of the rest of the arable layer.

Among all measured properties, the immobile water fraction, the near saturation hydraulic conductivity and the degradation half-life time (DT50) were there only properties that were found found to be highly variable. For those two last properties, a significant 'method effect' was identified for interpreting the measurement results. A robust direct fitting procedure was set-up for computing the conductivity with in situ infiltration measurements. For the calculation of the isoproturon DT50, no solution solves the critical difference between the 'effectively' two-phase degradation of the molecule and the the 1st order model used by pesticides fate models.

A close look at the statistical relations that exists between variables with both parametric and non-parametric methods revealed coherent but moderate links (and thus potentially determinisms) between the variables: an important part of the spatial variability is not explained by the measured agro-pedological variables. The impossibility of calibrating local classes or pedotransfer functions with a satisfying prediction error arises as a logic, but problematic, consequence of this ‘undetermined' variability of soils and isoproturon fate variability. It is only possible to consider to predict isoproturon adsorption. It does not seems to be possible to predict the other important properties influencing isoproturon fate in the topsoil of the studied area, using the measured properties together with the statistical analysis tested.

The PhD defense will be followed by a traditional acknowledgement snack that should allowed the audience to start more serious discussions...

Sincerely yours,

Julien Moeys

Additional information:

AgroParisTech–ENGREF, 19, avenue du Maine : picture and map

transport

from the 'gare du Nord' or the 'gare de l'Est' train stations : subway line 4, direction 'Porte d'Orléans', until 'Montparnasse-Bienvenue' station.

from the 'gare d'Austerlitz' train station : subway line 5, direction 'Place d'Italie', until 'Place d'Italie' station, then subway line 6, direction 'Charles de Gaule Étoile', until 'Montparnasse-Bienvenue' station.

from the 'gare de Lyon' train station : subway line 14, direction 'gare St Lazare', until 'Châtelet' station, then subway line 4, direction 'Porte d'Orléans', until 'Montparnasse-Bienvenue' station.

For any information, you can contact me at the following address:

jules

-website

oo.fr

PS: The e-mail address has to be reconstituted with both text and images above (Stop spam tips).

Soutenance de thèse :: 20/12/2007 :: Sol & Pesticide

Julien Moeys — 2007-12-05T10:41:14Z

English version | version anglaise

thèse en ligne (pdf)
titre
date, horaires et localisation
jury
mots clefs
résumé
laboratoire d'accueil
renseignements complémentaires

J'ai le plaisir de vous annoncer ma soutenance de thèse, intitulée :

La soutenance aura lieu le 20 décembre 2007, à 14h, dans les locaux de l'ENGREF (AgroParisTech)

Centre de Paris, 19 avenue du Maine (à 200 m de la gare Paris–Montparnasse), dans l'amphithéâtre 7, au rez-de-chaussée.

Elle sera soutenue publiquement devant un jury composé de :

M. Rafael ANGULO-JARAMILLO	ENTPE	Rapporteur
M. Guy SOULAS	INRA	Rapporteur
MME Liliane BEL	AgroParisTech	Examinateur
M. Dominique KING	INRA	Examinateur
M. Ludovic LOISEAU	AFSSA	Examinateur
M. Yves COQUET	AgroParisTech	Directeur de thèse

Mots clefs : Sol ; herbicide ; isoproturon ; variabilité spatiale ; déterminismes ; adsorption ; dégradation ; propriétés hydriques ; fraction d'eau immobile.

Résumé :

Le travail de thèse a pour objectif de mettre en évidence les facteurs agro-pédologiques déterminants pour le comportement d'un herbicide (l'isoproturon) dans l'horizon de surface des sols d'un secteur agricole de 2600 ha en Beauce chartraine, en se basant sur une caractérisation des propriétés du sol et de l'isoproturon et de leur variabilité spatiale.

Le travail s'inscrit dans le contexte des pollutions diffuses des nappes phréatiques par les pesticides, dont l'une des solutions envisageables est l'identification des secteurs géographiques présentant un risque accru de transfert de pesticides. La capacité à mettre en évidence les déterminismes agro-pédologiques de ces pollutions, et à modéliser statistiquement les relations entre les propriétés ‘élémentaires' du sol et le comportement des pesticides (classes ou fonctions de pédotransfert), est essentielle pour aboutir à une évaluation spatialisée des risques de transferts de pesticide.

Les sols du secteur étudié sont des sols moyennement épais développés dans un limon éolien reposant sur un calcaire gélifracté et cryoturbé. L'horizon de surface de 34 sites a été caractérisé, avec une détermination systématique des propriétés du lit de semence (propriétés physico-chimiques, hydriques et pédologiques du sol, adsorption et dégradation de l'isoproturon), et une détermination partielle du reste de l'horizon travaillé.

Parmi l'ensemble des propriétés mesurées , seuls la fraction d'eau immobile, la conductivité hydraulique au voisinage de la saturation, et le temps de demi-vie de dégradation de l'isoproturon (DT50) se sont avérés très variables. Pour ces deux dernières propriétés, un ‘effet méthode' conséquent a été identifié pour l'interprétation des résultats de mesure. Une procédure d'ajustement direct ‘robuste' a pu être mise au point pour le calcul de la conductivité à partir des mesures d'infiltration in situ. Pour le calcul de la DT50 de l'isoproturon, aucune solution ne résout l'inadéquation critique entre la cinétique de dégradation ‘effectivement' biphasique de la molécule et le modèle d'ordre 1 utilisé par les modèles pesticides.

Une étude attentive des liens statistiques entre les variables par des méthodes paramétriques et non-paramétriques révèle des liens (et donc des déterminismes potentiels) cohérents mais peu marqués entre les variables : une part importante de la variabilité spatiale n'est pas expliquée par les variables pédologiques et agronomiques mesurées. La conséquence logique, mais problématique, de cette variabilité ‘indéterminée' des propriétés du sol et de l'isoproturon est l'impossibilité d'établir des classes ou des fonctions de pédotransfert locales avec une erreur de prédiction satisfaisante. Seule la prédiction de l'adsorption de l'isoproturon peut être envisagée. Avec les propriétés mesurées et les méthodes d'analyse testées, il ne semble pas possible de prédire les autres propriétés importantes pour le devenir de l'isoproturon dans l'horizon de surface de ce secteur.

La soutenance sera bien entendu suivie d'un traditionnel pot de remerciement, ce qui permettra aux auditeurs d'aborder des questions plus sérieuses...

Bien cordialement,

Julien Moeys

Renseignements complémentaires :

AgroParisTech–ENGREF, 19, avenue du Maine : photo et carte

transport

depuis la gare du Nord ou la gare de l'Est : métro, ligne 4, direction Porte d'Orléans, jusqu'à la station Montparnasse-Bienvenue.

depuis la gare d'Austerlitz : métro, ligne 5, direction Place d'Italie, jusqu'à la station Place d'Italie, puis métro, ligne 6, direction Charles de Gaule Étoile, jusqu'à la station Montparnasse-Bienvenue.

depuis la gare de Lyon : métro, ligne 14, direction gare St Lazare, jusqu'à la station Châtelet, puis métro, ligne 4, direction Porte d'Orléans, jusqu'à la station Montparnasse-Bienvenue.

Pour plus d'information vous pouvez me contacter à l'adresse suivante :

jules

-website

oo.fr

PS : Il faut reconstituer l'adresse mail avec le texte et les images ci-dessus (Astuce anti-spam).